肯尼亚58.2646万平方公里，地跨赤道，东与索马里为邻，北与埃塞俄比亚、南苏丹共和国接壤，西与乌干达交界，南与坦桑尼亚相连。东南濒印度洋，海岸线长536公里，沿海为平原地带，其余大部分为平均海拔1500米的高原。

东非大裂谷东支纵切高原南北，将高地分成东、西两部分。大裂谷谷底在高原以下450－1000米，宽50－100公里，分布着深浅不等的湖泊，并屹立着许多火山。北部为沙漠和半沙漠地带，约占全国总面积的56%。中部高地的肯尼亚山海拔5199米，最高峰、非洲第二高峰，峰顶终年积雪。瓦加加伊死火山海拔4321米，以巨大的火山口（直径达15公里之大）而驰名。河流、湖泊众多，最大的河流为塔纳河、加拉纳河。

肯尼亚首都内罗毕，新宪法将全国分为47个郡。

肯尼亚地理上位于赤道附近，气候总体来说比较适中而且多样，气温虽然比较炎热，但只是在沿海地区，到了海拔高一些的地区则会有明显的低温天气，肯尼亚受季风气候的影响比较大，同赤道附近的很多国家一样，没有温度凸显的四季，只有雨季和旱季的区别。